Ведущая научная организация Российской Федерации принимает участие в разработке инструментов РусЭнергоПроект, начиная с 2009 года — периода основания компании.
Валерий Павлович Мешалкин, профессор и академик РАН, задействует в инженерных решениях РусЭнергоПроект главные достижения отечественной науки, потратив на изучение технологий повышения энергоэффективности более 40 лет исследовательской и прикладной деятельности.